类癌基因和抑癌基因基因表达PCR芯片可用于研究促进癌变的84个核心基因的表达。此芯片所含的基因，有致癌或抑癌或两者兼有，取决于肿瘤的类型也来源于已知的或相匹配的正常组织的基因表达差异。

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Human 1M在一张芯片上包含了超过一百万个探针信息，它最大限度的涵盖了人全基因组的全部信息。可用于全基因组分型研究和拷贝数变化的分析。

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CHO Gene2.0全转录组基因表达芯片专为中国仓鼠细胞系 (Chinese hamster ovary, CHO)设计，该芯片探针总数超过135万条，平均每个转录本最高达23条探针覆盖。

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本芯片中包含了直接调节能量摄入和消耗过程中与肥胖相关的基因。利用该芯片研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测肥胖相关基因的表达。

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人甲启动子甲基化芯片,2.1M,人甲基化芯片启动子区域Human DNA Methylation 2.1M Deluxe Promoter v2 Array 

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在继CytoScan® HD芯片上市大获成功之后，Affymetrix公司又在此基础上研发了一款更加适合临床诊断的细胞遗传学检测芯片。

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